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生物信息計算

  • 作者：編者:章樂
  • 出版社：科學
  • ISBN：9787030570772
  • 出版日期：2018/05/01
  • 裝幀：平裝
  • 頁數：146
人民幣：RMB 39 元      售價：元
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內容大鋼
    章樂主編的《生物信息計算》重點關注生物信息學中的計算問題，立足於生物學及工程方向前沿技術和問題的研究，向讀者展示生物學新方向並提供相關的應用實例。本書詳細介紹高性能計算和生物醫藥大數據研究，Hadoop和Spark在基因大數據挖掘方向的應用，天津、長沙、廣州超算中心的生物醫藥健康大數據平台。從最基本的雲計算理論體系人手，介紹雲計算在健康大數據方向的部署和應用，包括雲計算體系和架構及健康雲計算體系結構，並對其中的關鍵技術進行討論。針對生物影像技術，不僅對傳統的生物影像處理技術進行詳述，同時結合人工智慧、機器學習技術在此方面的應用進行解讀和挖掘。在基因序列比對問題上，針對雙序列比對和多序列比對進行展開。最後重點介紹蛋白質結構生物學問題，從蛋白質結構預測、比對等方面展開問題，並對相關理論和技術進行詳細的解讀。
    本書適用於生物醫學、生物信息學、電腦科學、電腦工程和相關專業的高年級本科生及低年級研究生，也適用於使用G0語言、具有堅實的計算和編程技能並希望能夠開展生物信息計算的研究者和實踐者。
作者介紹
編者:章樂
目錄
第1章  生物醫學信息的知識庫工程技術
  1.1  現有生物醫學信息知識庫系統簡介
  1.2  本體
    1.2.1  本體簡介
    1.2.2  GO基因本體
    1.2.3  本體建模
    1.2.4  本體工程
  1.3  基於本體構建的自動輔助診療系統
    1.3.1  自動輔助診療系統簡介
    1.3.2  系統結構
    1.3.3  規則編輯和推理
  參考文獻
第2章  高性能計算與生物醫藥大數據
  2.1  高性能電腦
  2.2  基於高性能計算的生物醫藥大數據技術簡介
  2.3  基因工程——人類全基因組重測序軟體流水線
  2.4  基因大數據——Hadoop和Spark加速基因大數據挖掘
  2.5  藥物大數據與藥物研發——大規模虛擬藥物篩選平台
  2.6  腫瘤信息學大數據分析平台
  2.7  生物醫藥文獻大數據挖掘技術
  2.8  國家三大超算中心上目前部署的生物醫藥大數據健康平台
    2.8.1  天津超算：構建生物醫藥研發平台和基因組學數據分析平台
    2.8.2  長沙超算：智慧醫療雲平台
    2.8.3  廣州超算：生物計算與個性化醫療應用服務平台
  參考文獻
第3章健康雲計算
  3.1  雲計算的基本概念
  3.2  雲計算體系架構及結構
    3.2.1  雲計算體系架構
    3.2.2  雲計算體結構
  3.3  雲計算中的關鍵技術
    3.3.1  虛擬化技術
    3.3.2  海量數據存儲與處理技術
  3.4  健康雲計算體系結構
  3.5  健康雲計算的數據採集與分析技術
    3.5.1  可穿戴心電信號檢測
    3.5.2  基於可穿戴感測器的行為監測
    3.5.3  人員定位與位置服務
  3.6  健康雲計算的典型應用
  參考文獻
第4章  生物影像處理
  4.1  醫學影像簡介
    4.1.1  基本概念
    4.1.2  發展歷史
  4.2  醫學圖像預處理
    4.2.1  圖像去噪
    4.2.2  圖像增強
  4.3  醫學圖像配准與融合
    4.3.1  基於互信息的醫學圖像配准
    4.3.2  基於多尺度的醫學圖像融合

  4.4  醫學圖像分割
    4.4.1  分水嶺圖像分割
    4.4.2  閾值分割演算法
    4.4.3  基於區域增長的圖像分割
    4.4.4  基於聚類的圖像分割
    4.4.5  圖論法
  4.5  醫學圖像特徵選擇
    4.5.1  基於聯合互信息的特徵選擇演算法
    4.5.2  基於灰色關聯分析特徵選擇演算法
  4.6  醫學圖像分類診斷
    4.6.1  基於統計學的分類方法
    4.6.2  基於機器學習的分類方法
    4.6.3  基於人工神經網路的分類方法
  參考文獻
第5章  基因序列比對
  5.1  序列比對的基礎知識
    5.1.1  編輯距離
    5.1.2  打分矩陣
    5.1.3  空位罰分模型
  5.2  雙序列比對
    5.2.1  點陣圖
    5.2.2  全局比對的動態規劃演算法
    5.2.3  局部比對的動態規劃演算法
  5.3  多重序列比對
    5.3.1  動態規劃演算法
    5.3.2  漸近比對演算法
    5.3.3  隱Markov模型比對
  5.4  序列比對工具應用
  參考文獻
第6章  蛋白質結構生物信息學
  6.1  蛋白質結構與功能
    6.1.1  概述
    6.1.2  蛋白質結構分類
    6.1.3  蛋白質功能的分類
  6.2  蛋白質結構預測
    6.2.1  概述
    6.2.2  同源建模法
    6.2.3  穿線法
    6.2.4  從頭預測法
  6.3  蛋白質結構比對
    6.3.1  概述
    6.3.2  DALI演算法
    6.3.3  CE演算法
參考文獻

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