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電腦輔助藥物設計導論(第2版)

  • 作者：編者:付偉//葉德泳
  • 出版社：化學工業
  • ISBN：9787122295651
  • 出版日期：2017/09/01
  • 裝幀：平裝
  • 頁數：272
人民幣：RMB 58 元      售價：元
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內容大鋼
    為了適應不同學科、不同層次的讀者需要，付偉、葉德泳編著的《電腦輔助藥物設計導論(第2版)》深入淺出地介紹了電腦輔助藥物設計的入門知識，包括藥物作用的基本理論、藥物設計的基本概念與方法、電腦輔助藥物設計的化學信息學和生物信息學系統、理論計算基礎、電腦輔助藥物設計的主要策略方法和技術，重點講解電腦輔助藥物設計的意義、作用和基本研究方法，選用一些典型的成功案例，並介紹最新的國內外研究成果，反映學科發展。同時介紹了一些常用軟體，提供化學和生物信息學資源，使本書兼具理論性和實用性。各章列出了參考文獻和選讀文獻，供讀者深入鑽研之需。書末附有專業名詞、軟體名和藥物名索引，便於讀者參考學習。
    本書可作為綜合性大學和醫藥院校本科生與研究生的教學用書，也可供有關科研人員參考。
作者介紹
編者:付偉//葉德泳
目錄
1  藥物設計的基本概念和理論基礎
  1.1  藥物的化學結構和特性
  1.2  藥物發現的途徑與過程
    1.2.1  藥物的偶然發現與隨機篩選
    1.2.2  天然有效成分作為先導化合物
    1.2.3  已有藥物作為先導化合物
    1.2.4  以藥物合成中間體為先導化合物
    1.2.5  組合化學方法產生先導化合物
    1.2.6  合理藥物設計
    1.2.7  先導化合物的優化和成藥性研究
  1.3  藥物作用的生物化學基礎
    1.3.1  蛋白質
    1.3.2  核酸
    1.3.3  ?
    1.3.4  糖類
    1.3.5  生物膜
  1.4  藥物作用的分子藥理學基礎
    1.4.1  受體學說及藥物-受體相互作用的方式和本質
    1.4.2  藥物-受體相互作用力的類型
    1.4.3  立體因素對藥物-受體相互作用的影響
    1.4.4  藥物-受體相互作用模型
    1.4.5  以核酸為靶點的藥物作用模型
    1.4.6  藥物與靶點作用的複雜性
  1.5  藥物的化學結構與生物活性的關係（SAR）
    1.5.1  藥效團、葯動基團和毒性基團
    1.5.2  藥效構象
  1.6  定量構效關係（QSAR）
    1.6.1  線性自由能相關方法
    1.6.2  Free-Wilson模型
    1.6.3  分子連接性法
  參考文獻
  進一步參考和選讀文獻
2  新葯發現中的化學信息學和生物信息學
  2.1  藥物研究中的信息處理
    2.1.1  化學信息學在藥物研究中的作用及應用
    2.1.2  生物信息學在藥物研究中的作用及應用
    2.1.3  數據挖掘在藥物研發中的應用
  2.2  化學小分子的處理
    2.2.1  化學結構的編碼
    2.2.2  分子結構的電腦表示
    2.2.3  化學結構信息的存儲
    2.2.4  分子性質的表示
    2.2.5  電腦分子模型技術及結構顯示
  2.3  分子相似性搜索
    2.3.1  基本概念
    2.3.2  相似度計算公式
    2.3.3  分子相似性搜索的應用
  2.4  合成反應信息處理和電腦輔助有機合成設計
  2.5  生物大分子的信息處理
    2.5.1  序列分析和比對

    2.5.2  蛋白質結構預測
    2.5.3  蛋白質功能預測
  2.6  與新葯研發相關的資料庫
    2.6.1  化合物資料庫
    2.6.2  化學信息資料庫
    2.6.3  藥學信息綜合平台
    2.6.4  藥物靶點資料庫
    2.6.5  中藥資料庫
    2.6.6  藥效團資料庫
    2.6.7  分子生物學資料庫
  2.7  信息計算新技術
    2.7.1  集群計算
    2.7.2  網格計算
    2.7.3  雲計算
    2.7.4  信息計算新技術在醫藥行業中的應用
  參考文獻
  進一步參考和選讀文獻
3  有關理論計算、技術和設備
  3.1  常用的計算類型
    3.1.1  勢能面
    3.1.2  單點能
    3.1.3  幾何優化
    3.1.4  分子性質計算
    3.1.5  構象分析
  3.2  理論計算基礎
    3.2.1  量子化學
    3.2.2  分子力學
    3.2.3  量子力學與分子力學相結合的方法（QM/MM）
    3.2.4  分子動力學模擬方法
    3.2.5  自由能計算
  3.3  數據統計分析方法
    3.3.1  模式識別法
    3.3.2  人工神經網路方法
  3.4  藥物和生物大分子三維結構測定的實驗方法和技術
    3.4.1  蛋白質三維結構的測定方法
    3.4.2  藥物-蛋白結合位點的測定方法
    3.4.3  藥物-蛋白結合和結合常數的測定方法
  參考文獻
  進一步參考和選讀文獻
4  電腦輔助藥物設計的意義
  4.1  電腦輔助藥物設計的產生和作用
  4.2  電腦輔助藥物設計的特徵
    4.2.1  多學科交叉的前沿領域
    4.2.2  大量化學信息的電腦計算處理
    4.2.3  大量高技術軟體產品的產生
  4.3  電腦輔助藥物設計的評價和展望
  參考文獻
  進一步參考和選讀文獻
5  電腦輔助藥物設計方法學
  5.1  直接藥物設計

    5.1.1  活性位點分析
    5.1.2  基於靶點結構的三維結構搜尋
    5.1.3  全新藥物設計
    5.1.4  蛋白結構預測
  5.2  間接藥物設計
    5.2.1  基於藥效團模型的藥物設計與虛擬篩選
    5.2.2  基於配體相似性的虛擬篩選
    5.2.3  3D-QSAR法
  5.3  電腦輔助藥物設計新策略和新方法
    5.3.1  基於序列的藥物設計
    5.3.2  基於片段的藥物設計
    5.3.3  多靶點藥物設計
    5.3.4  網路藥理學
    5.3.5  反向對接
    5.3.6  組合化學與合理藥物設計的結合策略
  參考文獻
  進一步參考和選讀文獻
6  先導化合物優化
  6.1  從苗頭到先導與先導化合物優化
  6.2  先導化合物優化的原則及策略
    6.2.1  配體效率與配體親脂性效率
    6.2.2  類先導化合物性與三倍律
    6.2.3  先導化合物優化原則
    6.2.4  先導化合物優化基本策略
  6.3  化合物藥效學性質的優化
    6.3.1  基於靶點結構的優化
    6.3.2  基於片段結構的優化
    6.3.3  基於配體結構的優化
    6.3.4  骨架躍遷
  6.4  化合物葯動學性質的優化
    6.4.1  葯代動力學的意義
    6.4.2  基於性質藥物設計優化的目標
    6.4.3  成藥性
    6.4.4  類藥性與五倍律
    6.4.5  葯動學性質的預測優化
  參考文獻
  進一步參考和選讀文獻
7  電腦輔助藥物設計應用實例
  7.1  基於靶點蛋白結構的藥物設計案例
    7.1.1  抗流感病毒藥物設計——基於唾液酸?結構的藥物設計
    7.1.2  AChE抑製劑的研究——基於AChE晶體結構的藥物設計
    7.1.3  SARS病毒3CL主蛋白?抑製劑的研究——基於同源蛋白結構的藥物設計
  7.2  基於虛擬篩選的藥物設計案例
    7.2.1  5-羥色胺1A受體激動劑FW01的發現
    7.2.2  5-羥色胺1A受體激動劑FW01的結構改造和優化
  7.3  基於藥效團模型的藥物設計案例
    7.3.1  非核?類NS5B小分子抑製劑的研究——基於配體的藥效團模型
    7.3.2  針對花生四烯酸代謝網路的抗炎藥物研究——基於多靶點蛋白的藥效團模型
  7.4  基於性質的藥物設計案例
    7.4.1  抗瘧疾藥物代謝穩定性的性質預測

    7.4.2  代謝部位的預測步驟
    7.4.3  代謝部位的預測結果及分析
  7.5  基於片段的藥物設計案例
    7.5.1  抗凋亡蛋白Bcl-2抑製劑的發現
    7.5.2  基於NMR的片段篩選和基於片段的Bcl-2抑製劑設計
    7.5.3  Bcl-2抑製劑先導化合物優化
  7.6  基於反向對接的靶點識別案例
    7.6.1  天然產物咖啡?酪胺抗幽門螺旋桿菌作用新靶點?脫甲?基?（PDF）的發現——作用靶點預測
    7.6.2  基於結構的系統生物學和反向對接驗證吉非替尼的脫靶效應——不良反應預測
  參考文獻
索引

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